cyanolyase.genouest.org
CyanoLyase
http://cyanolyase.genouest.org/blast
Blast 2.2.26. Blastp (protein query, protein databank). Blastx (nucleotide query, protein databank). Highly similar sequences (megablast). More dissimilar sequences (discontiguous megablast). Somewhat similar sequences (blastn). PSI-BLAST (Position-Specific Iterated BLAST). PHI-BLAST (Pattern Hit Initiated BLAST). DELTA-BLAST (Domain Enhanced Lookup Time Accelerated BLAST). PSI-BLAST, PHI-BLAST and DELTA-BLAST can be used to find distantly related sequences. FASTA format. Length is limited to 20Mb. RS991...
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Chromophorylation of apoproteins in each strain
http://cyanolyase.genouest.org/pigmentation
Chromophorylation of apoproteins in each strain. Click here to see only marine picocyanobacteria]. This table lists the position of the cysteinyl binding sites (a consensus numbering is used for allophycocyanin, phycocyanin and phycoerythrin I; see Sidler, 1994. Shukla et al. in revision. Abbreviations: PCB, phycocyanobilin; PEB, phycoerythrobilin; PUB, phycourobilin; PVB, phycoviolobilin; BL, blue light; GL, green light; PBP, phycobiliproteins. Biochemically determined pigmentations are indicated in bold.
rfqm2017.com
Partenaires - RFQM 2017
http://www.rfqm2017.com/partenaires
Rencontres Francophones sur la Qualité et la Mesure - RFQM 2017 - du 27 au 30 mars 2017 à NANTES, France. Présidents des RFQM 2017. À propos de Nantes. Comment faire sa demande de visa. Inscrivez-vous dès maintenant pour pouvoir suivre les 15 ateliers proposés. Le nombre de places est limité. Pour connaître l'ensemble des communications retenues pour les prochaines Rencontres Francophones sur la Qualité et la Mesure RFQM 2017. Présidents des RFQM 2017. À propos de Nantes. Comment faire sa demande de visa.
cyanolyase.genouest.org
Characterized or predicted function of phycobilin lyases
http://cyanolyase.genouest.org/functions
Characterized or predicted function of phycobilin lyases. This table lists the characterized (roman) or predicted (italics) function of phycobilin lyases in vivo, in terms of their:. Chromophore bound: phycocyanobilin (PCB) or phycoerythrobilin (PEB). Enzymatic activity: lyase or lyase-isomerase. Note that a PCB lyase-isomerase will bind a PCB and isomerize it into phycoviolibilin (PVB) and that a PEB lyase-isomerase will bind a PEB and isomerize it into phycourobilin (PUB). Note that marine Synechococcus.
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Genomes
http://cyanolyase.genouest.org/genomes
This page lists publicly available genomes of cyanobacteria, red algae and cryptophytes or organelles containing one or more phycobilin lyases and related proteins. Details on the phylogeny (phylum, order, genus, species) are indicated for all strains, but lower taxon levels (subcluster, clade, subclade) are specified only for marine picocyanobacteria, as determined by comparing whole genomes ( Kettler et al., 2007. Dufresne et al., 2008. 16S rDNA genes ( Fuller et al., 2003. Draft - assembled contigs.
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All phycobilin lyases and related proteins
http://cyanolyase.genouest.org/family/all/39
All phycobilin lyases and related proteins. This list allows users to retrieve any sequence from any organism included in the database by its locus tag/orf id or Genbank number when available. The R-PC-III present in this strain has a PCB:PEB ratio of 2:1 (Sidler, 1994). It is unclear whether WH7805 has CpcE/F or RpcE/F but the presence of CpcT (and not RpcT) however argues for the following pigmentation: alpha-84=PEB; beta-84=PCB; beta-155=PCB. Unclear whether this strain has CpcE/F or RpcE/F. Unclear w...
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EMME PROJECT
http://emme.genouest.org/omeroDesc
Est un logiciel client-serveur pour la visualisation. Des images issues de la microscopie en biologie. Ce logiciel dispose d'outils capables d'importer des images en les organisant au sein de projets. De plus, OMERO permet un visionnage des images et de leurs analyses via des scripts. Pour finir, l'export d'images pour l'analyse ou la publication est également réalisable. Locale) et OMERO.web. Fournit un ensemble d'outils permettant l'accès et l'utilisation des données dans un serveur OMERO. New ISAtools...
emme.genouest.org
EMME PROJECT
http://emme.genouest.org/infos
Associée aux équipe de recherche Genscale et Dyliss (Groupe Symbiose). Du centre de recherche INRIA Bretagne-Atlantique, la plate-forme GenOuest. Propose un ensemble d’outils bio-informatiques. Des banques de données publiques mises à jour régulièrement. Elle propose également la prise en charge de projets de développement. En bio-informatique ainsi que des formations. GenOuest est une plateforme de service publique gratuite. Dont le but est d’aider la communauté bio-informatique. EMME infrastructure pre...
SOCIAL ENGAGEMENT