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ABINIT程序包是基于密度泛含理论 Density Functional Theory, DFT ，采用赝势和平面波基矢的方法来处理由电子和核所组成的体系 分子和具有周期性结构的固体 ，它可以计算体系的总能、电荷密度以及电子结构。 在含 时密度泛含理论的框架下可以计算分子体系的激发态，也可以基于多体微扰论 GW近似 来处理激发态。 官网 http:/ www.abinit.org/. 相关网站 http:/ www.scm.com/. 力场和代码是分开的， 一些软件中包含amber力场, 而其他的力场也包含在此amber的软件中。 AMBER提供两部分内容 用于模拟生物分子的一组分子力学力场 无版权限制，也用于其它一些模拟程序中 分子模拟程序软件包，包含源代码和演示 有版权限制，需要购买。 官网 http:/ ambermd.org/. 对Athena ATLAS离线物理模拟和分析软件 进行多核改进，并采用了ROW Read on Write 方式的共享内存方式。 官网 http:/ www.charmm.org/. 官网 http:/ www.cp2k.org/.
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